Прежняя версия сайта уже не могла полноценно отражать в интернет-пространстве жизнь и деятельность старейшего высшего духовного учебного заведения Русской Православной Церкви. Поэтому создание нового сайта было одной из первых задачей, поставленных ректором Московской духовной академии и семинарии архиепископом Верейским Евгением перед образованной в первой половине 2008 года пресс-службой МДА.

Новый сайт академии, доступный по адресу www.mpda.ru, в настоящее время содержит общую справочную и историческую информацию об Академии и Семинарии, информацию об учебном процессе и о научной жизни в Академии, в частности о жизни кафедр. Пополняется база биографических данных профессоров и преподавателей Духовной школы.

Особый раздел посвящен сектору заочного обучения и содержит всю информацию, необходимую студентам-заочникам. На сайте освещены такие стороны академической жизни как работа библиотеки, быт студентов, в ближайшее время появится подробная информация об издательской и IT-деятельности академии.

Регулярно обновляется новостная лента. С открытием нового сайта стало возможным размещение фотогалерей в высоком разрешении, в частности — фотоэкскурсий по Академии (раздел разрабатывается).

В ближайшее время планируется размещение базы данных по свободным и закрепленным темам дипломных работ и кандидатских диссертаций, а также базы данных защищенных работ. Также будет открыта электронная библиотека, страница публикаций членов профессорско-преподавательской корпорации и студентов, страницы, посвященные академическим святым, историческим лицам академии, и в целом — выпускникам академии и семинарии.

Планируется открытие подсайтов Регентской и Иконописной школ, Греко-латинского и Церковно-археологического кабинета. Сейчас эти подсайты проходят стадию разработки.

В дальнейшем на сайте должен появиться форум, а также предусмотрена возможность консультации с преподавателями духовных школ.